Mais que 85 por cento da chuva anual cai entre 1º de Outubro a 1º de Abril. Nos cerrados da região Centro-Oeste, a precipitação pluvial pode alcançar 2000 mm. (80 polegadas) por ano, enquanto no Nordeste, a precipitação anual tem uma média de 800 a 1000 mm (30 - 40 polegadas). Algumas vezes, a intensidade da precipitação pluvial pode ser alta, alcançando de 80 a 100 mm. (3 a 4 polegadas) por hora.

A vegetação nativa é influenciada por fatores tais como altitude, precipitação pluvial e solo. A vegetação dominante nativa é de arbustos de baixo-crescimento e árvores atrofiadas distribuídas irregularmente através de terrenos com relva. Em algumas regiões os terrenos com relva prevalecem sem árvores.

A média da precipitação pluvial é geralmente suficiente para a produção comercial do produto agrícola em grande parte dos cerrados, mas curtas mini-secas (veranicos) de uma a quatro semanas podem ocorrer, especialmente entre Janeiro e Fevereiro. Estes períodos de seca durante a estação chuvosa faz a produção de alguns produtos agrícolas ser de risco nas áreas mais secas dos cerrados. Nestas áreas, a soja é o produto agrícola dominante, visto que a soja vegetal é menos sensível aos veranicos que outros produtos agrícolas de terras de sequeiro.